电影《末日深眠》讲述了一个发生在庇护所内的故事。在末日废土时代，已经没有可供呼吸的新鲜空气，人类大量灭绝，剩余的极少数人类精英通过方舟计划冬眠在地下的庇护所内。两位工程师鲍尔和卡特莱特是负责庇护所的日常维修和危险检测工作。他们在这个与外界隔绝的地下冷藏系统中度过了很长一段时间，每天都要面对着机器的故障和各种未知的危险。然而，他们的生活并不如他们所想象的那么顺利，突如其来的事件打乱了他们的原本的计划和安排

鲍尔和卡特莱特都是精英人类，他们对人类的未来寄予了很大的希望。然而，在庇护所内，他们却开始了一场与自己的精神世界搏斗的挣扎。在这样一个与世隔绝的地方里，他们必须面对着孤独、恐惧和绝望。而当他们的庇护所开始出现各种问题的时候，他们的精神状况也开始变得越来越糟糕。

卡特莱特在工作中隐藏了一个秘密，就是他有个新婚的妻子，而那个妻子正是冬眠的精英人类之一。在这个与外界隔绝的地下冷藏系统中，他们的感情被隔离了。突然的机器故障和奇怪的事件一直在发生，使得这两人之间的感情出现了裂痕。在这人类灭绝的时间里，他们最后遇到的都是困难的抉择，如果只能活下其中一人，该是谁呢？