《X医生：外科医生大门未知子》讲述了主人公大门未知子，一位派遣医生，对外科医学的执着追求和坚持，以及她在东帝大学医院面对医疗失误、派系斗争和权力斗争的挑战。东帝大学医院曾是国内大学医院中的顶尖存在，但近年来却因不可告人的行为和医疗失误而受到质疑和评价下滑。

剧中，大门未知子被雇用进入东帝大学医院，深入由蛭间重胜执掌的权力核心。蛭间重胜一直对大门未知子怀恨在心，并计划重新建立医院的品牌形象，夺取新院长的位子。未知子本着“拯救眼前的生命”为己任，不妥协地为手术和治疗的成功而努力奋斗。在东帝大学医院内，她面对着历史上最危险和最强大的对手之一，副院长久保东子。

随着剧情的发展，大门未知子将在医院的“敌阵”中不断成长，她面对医疗界的种种问题，与久保东子等强大对手展开激烈的较量。在这一过程中，她也必须直面过去的阴影和个人的成长。

这部剧通过展现医生在专业和个人成长过程中的挑战，以及对医疗伦理和职业道德的坚守，向观众展示了一个医疗剧中扣人心弦的故事。